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基于16S rDNAs的快速检测血液细菌污染的荧光定量PCR研究
作者:王永智 薛利军 任浩 赵平 朱诗应 李冕 戚中田 
单位:第二军医大学微生物学教研室全军医学微生物学重点实验室 上海 200433 200433 上海 第二军医大学微生物学教研室全军医学微生物学重点实验室 南京军区南京总医院肿瘤科 
关键词:细菌污染 16S rDNAs 荧光定量PCR 
分类号:NULL
出版年,卷(期):页码:2007,1(4):203-209
摘要:
目的 探讨快速筛选血液及血液制品中细菌污染的方法.方法 对20余种常见致病性细菌的16S rDNAs进行多序列比对,设计扩增细菌16S rDNAs基因的荧光定量PCR(FQ-PCR)通用引物.以12种致病菌、2种真菌、1种支原体、1种病毒和人基因组DNA为模板,验证通用引物检测细菌的特异性.通用引物扩增金黄色葡萄球菌16S rDNA靶片段,构建标准质粒pMDT-Bfr,并建立FQ-PCR定量标准曲线.分别以金黄色葡萄球菌和大肠埃希菌作为革兰阳性和革兰阴性细菌代表菌,以其不同浓度的DNA为模板进行FQ-PCR反应,检验该方法的敏感性.抽提梯度稀释的金黄色葡萄球菌和大肠埃希菌模拟血液细菌污染标本的总DNA作为FQ-PCR反应模板,检验基于16S rDNAs的FQ-PCR作为血液细菌污染检测方法的敏感性.结果 设计的FQ-PCR通用引物有较高的特异性,仅能检测出细菌的16S rDNAs;用该方法检测革兰阳性和革兰阴性菌,对于浓度在103拷贝/μl以上的16S rDNAs基因都可以准确定量;以该方法检测血液细菌污染模拟标本,灵敏度可达到105CFU/ml.结论 初步建立了以16S rDNAs作为FQ-PCR靶基因快速检测血液细菌污染的方法.该方法特异性强、灵敏度高、成本低廉,具有很好的研究价值与应用前景.
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基金项目:
  A军队"十一五"医药卫生科研基金  B06Z026,06Z027  D1
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