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基于16S rRNA测序分析糖尿病尿路感染者尿液菌群特征
作者:尹九湖     卢晓明   孙科   易忠权   沈园园 刘亚东   
单位::224000 盐城市 盐城市第三人民医院 
关键词:糖尿病 尿路感染 菌群 16S rRNA 
分类号:
出版年,卷(期):页码:2023,17(3):164-172
摘要:

     【摘要】目的 探讨16S rRNA测序技术在糖尿病尿路感染者尿液菌群特征分析中的应用。方法 收集于2021年3月至2021年9月盐城市第三人民医院泌尿外科、内分泌科门诊及住院患者的尿液样本,对糖尿病尿路感染者(DI)(12例)及非尿路感染人群(DNI)(12例)、正常人群(NOR)(9例)及单纯尿路感染者(UTI)(7例)尿液菌群16S保守区V3、V4进行测序分析。利用Alpha和Beta多样性指数分析尿液菌群的丰度和均匀度及组间差异。对不同分组进行菌群物种组成分析,利用R软件包绘制菌群间相关性热图。利用BugBase软件分析预测各组菌群表型。结果 在Alpha多样性分析中,DI组与NOR组患者observed species指数、香农指数(shannon)、辛普森指数(simpson)以及chao1指数4个指标差异均有统计学意义(t = 2.833、P = 0.011,t = 3.619、P = 0.002,t = 2.82、P = 0.011,t = 2.69、P = 0.017)。PCoA分析4组间Beta多样性差异无统计学意义(F = 1.71、P = 0.071),DI与DNI组菌群组成差异有统计学意义(F = 2.56、P = 0.031)。在物种组成分析中,在门水平,厚壁菌门在DI组与DNI组患者尿液样本中差异有统计学意义(Z =-2.425、P = 0.014,);在属水平,乳酸菌属(Lactobacillus)(Z =-2.175、P = 0.03)、Negativicoccus(Z =-2.685、P = 0.007)、理研菌属(Rikenella)(Z =-2.134、P = 0.033);卟啉单胞菌属等14类菌属在DI组与NOR组差异均有统计学意义(P均< 0.05);Vulcaniibacterium属在DI组与UTI组患者尿液样本差异有统计学意义(Z =-2.405、P = 0.019)。菌群相关性分析结果显示,DI组患者中变形菌门与放线菌门(r =-0.73、P =0.007)、厚壁菌门(r =-0.67、P = 0.017)呈负相关。菌群表型预测结果显示,DI组与DNI组患者生物膜形成表型差异有统计学意义(Z =-2.456、P = 0.014)。结论   DI组患者菌群丰度与均匀度较NOR组显著下降。变形菌门和放线菌门、厚壁菌门的菌群失衡,可能导致生物膜形成表型差异,进而引起

糖尿病患者尿路感染易感性增加。
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