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五例恙虫病东方体感染基因型及其基因变异
作者:姚立农   陆群英   阮卫   占喆   朱水荣   姜理平  
单位:310051 杭州市 浙江省疾病预防控制中心 
关键词:立克次体病 恙虫病 恙虫病东方体 基因型 基因变异 
分类号:
出版年,卷(期):页码:2020,14(2):110-116
摘要:

    【摘要】目的 旨在了解浙闽地区人群恙虫病东方体感染的基因型,并分析其基因变异。方法 采用细胞培养从浙闽地区5例散发恙虫病患者发热期血中分离病原体;提取感染细胞DNA,巢式PCR扩增完整恙虫病东方体56-kD型特异性抗原(TSA)基因和热休克蛋白基因(groESL)并测序;采用MEGA 7.0软件,进行序列比对和系统发生分析。结果 病原学确认5例恙虫病患者,并分离到恙虫病东方体菌株。序列比对表明,5菌株中2株的56-kD TSA基因和groESL基因100%一致,另2菌株的此二个基因序列也100%一致,分别将两组菌暂时命名为浙江-1型和浙江-2型。56-kDa TSA基因比对和系统发生分析表明,浙江-1型和浙江-2型分别与台湾-A基因型和Gilliam-C基因型亲缘较近(98.45%和98.50%),但有明显变异;另1株菌Wuj/2014与台湾-A基因型高度相似(99.94%)。分析56-kDa TSA基因各基因型支系的时间树表明,台湾-A基因型、浙江-1型和浙江-2型3支系与祖先的分歧时间相对其他原型株晚,尤其是浙江-2型,说明这些基因型或亚型在恙虫病东方体的进化过程中出现较晚。结论 本研究人群存在不同恙虫病东方体基因型的感染,可能为未被认识的新的基因亚型,迫切需要进行全基因组测序确认,并探讨其基因变异与人恙虫病严重程度间的关系。

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