【摘要】 目的 比较我国布鲁菌强毒株与不同疫苗株基因组间的差异，寻找布鲁菌强毒株及不同种群布鲁菌所特有的基因。 方法 利用布鲁菌全基因组DNA芯片，进行牛、羊布鲁菌强毒株及我国常用布鲁菌疫苗株M5株（羊种）、S2株（猪种）、S19株（牛种）和104M株（牛种）间比较基因组学研究，寻找布鲁菌强毒株及不同种群布鲁菌特有的基因。 结果 在牛和羊布鲁菌强毒株中共发现263个在所有疫苗株中缺失的基因；发现BMEII0827-BMEII0849基因片段在牛布鲁菌疫苗株与强毒株中均缺失，而在羊及猪布鲁菌中能检测到；在猪布鲁菌疫苗株中比牛、羊布鲁菌缺失了一个BMEI1684-BMEI1702的基因片段。 结论 通过DNA芯片比较基因组学的研究，寻找到布鲁菌强毒株及不同种群布鲁菌所特有的基因，为布鲁菌致病机制的研究提供了靶标。