【摘要】 目的 分析柯萨奇病毒A组16型（CoxA16）西安分离株VP1基因序列，探讨西安分离株基因亚型以及病毒颗粒的生物学特性。 方法 采集临床诊断为手足口病患儿的粪便标本，RT-PCR方法检测粪便标本，CoxA16核酸检测阳性的粪便标本经处理后接种于RD细胞分离病毒。扩增CoxA16分离株VP1基因序列并测序。利用DNA Man、ClustalX 1.83和MEGA 4.0软件分析VP1基因和氨基酸序列。纯化CoxA16病毒颗粒，福尔马林灭活后电镜观察病毒颗粒的形状。 结果 成功从粪便标本中分离CoxA16病毒株，并获得CoxA16分离株VP1基因序列，该核苷酸编码区序列长度为891 bp，编码297个氨基酸序列；VP1基因比对显示，该分离株与其他不同地区的代表株核苷酸和氨基酸同源性分别为76.76%～97.57%和92.16%～100.0%；种系进化分析显示分离株属于B1a基因亚型的一个分支，与BJ10-03同属一个分支。透射电镜下病毒颗粒为20面体立体对称，病毒颗粒大小均匀，直径为20～30 nm。 结论 西安CoxA16分离株属于B1a基因亚型，分离株在形态上与其他肠道病毒相似。