【摘要】 目的 掌握2012年度北京大学北京地坛医院教学医院手足口病住院患儿的病原体分布情况与变化趋势，为手足口病的防治提供科学依据。 方法 本研究收集北京大学北京地坛医院教学医院儿科2012年度211例手足口病住院患儿的咽拭子标本，提取病毒RNA，采用实时荧光聚合酶链反应（RT-PCR）法，进行肠道病毒（EV）通用型、肠道病毒71（EV71）型和柯萨奇A16（CoxA16）型肠道病毒核酸检测。EV（+）标本判为EV阳性，EV（+）EV71（+）标本判为EV71阳性，EV（+）CoxA16（+）标本判为CoxA16阳性，EV（+）且EV71（－）CoxA16（－）标本判为非EV71非CoxA16型肠道病毒阳性。 结果　2012年度211例本院手足口病住院患儿中EV阳性标本共118例，占55.92%。病毒分型结果显示，非EV71非CoxA16型肠道病毒阳性标本共46例，占22.81%；EV71阳性标本共45例，占21.32%；CoxA16阳性标本共27例，占12.80%。病原学分布分析结果显示，5～7月份为发病高峰期；不同年龄、性别组患儿之间病原体构成无显著差异；患儿入院前3 d肠道病毒检出率较3 d后高；不同型别肠道病毒感染患儿之间平均住院天数差异无统计学意义。 结论　2012年度本院手足口病住院患儿不同型别EV感染率由高到低依次为：非EV71非CoxA16型肠道病毒、EV71、CoxA16，非EV71非CoxA16型肠道病毒感染率较往年具有升高趋势，尚待进一步研究。