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手足口病（hand，foot and mouth disease，HFMD）是婴幼儿常见传染病，主要表现为发热，手、足和口腔部的疱疹，由非脊髓灰质炎肠道病毒属的柯萨奇病毒（Coxsackievirus）A（CoxA）和B组，埃可病毒（ECHO viruses）4、6、7型等感染引起，CoxA16和人肠道病毒71型（enterovirus 71，EV71）感染尤其常见。1958年，加拿大首次分离出CoxA16[1]，1969年，加利福尼亚首次报道了EV71[2]，至1972年美国纽约、孟加拉国、澳大利亚陆续出现中枢神经系统感染流行时才真正分离出EV71病毒[1]。早期发现的手足口病病原体主要为CoxA16，20世纪70年代后，EV71与CoxA16感染交替出现，成为手足口病的主要病原体[3]。二者均在世界范围内引起多次暴发。CoxA16：美国（1968年）[4]、日本（1970年）[5]、澳大利亚（1991年）[6]、台湾（2006至2008年）[7]、西班牙（2009年）[8]；EV71：马来西亚（2000至2003年）[9]、新加坡（2000年）[10]、泰国（2008至2009）[11]、韩国（2008至2009年） [12]、中国阜阳（2008年）[13]。显然，手足口病已成为一种世界性疾病，已引起了全世界人民的重视。本文拟从病原学、临床表现、病毒基因型和核苷酸序列与临床表现的关系以及发病机制方面，对手足口病的两种主要病原体，即EV71和CoxA16的区别和联系进行综述。
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