【摘要】  目的  探讨泉州地区乙型肝炎病毒（HBV）慢性感染者HBV S基因变异与临床疾病的关系。方法  采用将PCR产物直接测序技术对43例慢性HBV感染者的HBV S区进行序列测定及序列分析。 结果  43例慢性HBV感染者中共检出基因B型29例（29/43，67.44%），C型14例（14/43，32.56%）；血清学分型adw型28例（28/43，65.12%），adr型14例（14/43，32.56%），ayw型1例（1/43，0.02%）。43例慢性HBV感染者共检出HBsAg氨基酸（aa）变异位点32个，较常见的aa变异位点为sY200F、sM213I、sI126T和sF85C，这些变异位点多见于肝功能衰竭患者。HBV主要亲水区（MHR）共检出aa变异19例（19/43，44.19%），aa替换位点12个。MHR区最常见的变异位点为aa126（7/23，30.43%），其次为aa140（3/23，13.04%）。基因B型患者中sT126I/A变异2例（2/29，6.90%），基因C型患者中sI126T变异5例（5/14，35.71%），基因C型患者中aa126变异率显著高于基因B型（χ2=5.753，P< 0.05）。肝功能衰竭患者aa126变异率为26.67%（4/15），高于慢性乙型肝炎患者10.71%（3/28），但差异无统计学意义（χ2=1.824，P> 0.05）。肝功能衰竭患者HBV S基因变异率在“a”决定簇上显著高于慢性乙型肝炎（χ2=4.268，P< 0.05）。 结论  泉州地区HBV基因型（血清型）以B型（adw）为主，其次为C型（adr）。部分HBV S区基因变异，与HBV基因型的异质性有关，可能与严重肝病有一定的相关性。