目的 探讨数目可变串联重复序列（VNTR）方法在北京基因型结核分枝杆菌菌株识别中的价值，并与间隔区寡核苷酸分型（spoligotyping）法进行比较。方法 对50株临床结核分枝杆菌行核酸抽提后，以12个VNTR位点引物分别扩增，对所得的指纹图谱进行分析，并与Spoligotyping结果比较。结果 本研究中采用的12个VNTR位点均具有多态性。Spoligotyping分型有88%（44/50）菌株为北京基因型。相同Spoligotyping基因型的43株菌用VNTR可分为24种基因型。VNTR的各个多态性位点中对北京基因型菌株辨别力最高的是MIRU26位点。结论 VNTR可作为结核分枝杆菌分子流行病学调查的初筛方法，结合Spoligotyping可进行北京基因型菌株的识别。